Kelompok privateer yang dikenal sebagai Blue Steel melanjutkan misi mereka untuk mengirimkan cetak biru torpedo hulu ledak getaran, senjata yang dapat membalikkan keadaan perang demi keuntungan mereka, ke Amerika Serikat. Namun, ancaman baru muncul dari musuh mereka, armada kabut yang sangat besar dalam bentuk “Dewan Mahasiswa”, sekelompok kapal perang yang terdiri dari model mental yang tersisa, avatar humanoid kapal, yang belum menghadapi kapten Blue Steel yang tidak terduga, Gunzou Chihaya. Saat Blue Steel semakin dekat untuk memahami asal-usul otoritas yang mengendalikan musuh, masa lalu Iona mengungkap awal perang dan alasannya berpihak pada manusia.