Sebelum Sam Axe bekerja sama dengan Michael dan Fiona, ia adalah Komandan Axe, Pasukan Khusus Angkatan Laut AS. The Fall of Sam Axe menceritakan kisah bagaimana Sam berubah dari komandan angkatan laut yang disegani menjadi pria misterius yang kita kenal dengan sebutan Burn Notice. Dalam misi militer terakhir Sam, ia dikirim ke hutan Kolombia untuk menyelidiki klaim organisasi teroris kejam yang dikenal dengan sebutan “Espada Ardiente” (Pedang Api). Misinya: untuk menentukan apakah bantuan militer AS diperlukan untuk menghadapi ancaman tersebut. Namun, saat ia tiba, keadaan menjadi lebih rumit dari yang dibayangkannya. Ia menerima kabar bahwa pemberontak telah menargetkan klinik sipil kecil di tengah hutan. Kini, Sam harus menyelamatkan para dokter dan pasien klinik dari kematian. Namun, tidak ada yang seperti yang terlihat dan Espada Ardiente mungkin bukan ancaman terbesar yang dihadapi Sam Axe.