Profesor Klon yang jahat kembali… kali ini, bukan hanya untuk menggulingkan pemerintah dan menjadi presiden Metrofulus, tetapi juga untuk mengendalikan persediaan air tawar dunia melalui rencananya yang cerdik, “air hitam”. Ketika planet biru kita hanya memiliki waktu 72 jam sebelum berubah menjadi hitam, Cicakman datang untuk menyelamatkannya. Namun, yang sangat mengejutkannya, dia menghadapi musuh lamanya, bocah-bocah berambut merah, yang kembali bahkan lebih kuat dalam bentuk spiritual… sebagai hantu-hantu berambut merah. Selain itu, dia sekarang berhadapan dengan pembunuh bayaran Profesor Klon, Rrama… seorang pembunuh yang mendapatkan kesenangan dalam membunuh seolah-olah itu adalah bentuk seni murni.