Banyak teknisi dari seluruh dunia berkumpul di fasilitas kelautan Interpol “Pacific Buoy” di Hachijo-Jima, di laut selatan pesisir prefektur Tokyo bagian tengah, untuk menyaksikan peluncuran sistem baru yang menghubungkan semua sistem kamera penegak hukum di seluruh dunia dan memungkinkan pengenalan wajah di seluruh dunia. Conan, bersama teman-temannya Kogoro, Ran, Agasa, Haibara, dan Detektif Cilik, juga menuju pulau itu dengan undangan dari Sonoko untuk melihat paus. Ia menerima pesan dari Subaru, yang mengatakan bahwa seorang agen Europol telah dibunuh di Jerman oleh Gin. Merasa terganggu, Conan menyelinap ke kapal polisi yang dipimpin oleh Kuroda, yang membawa mereka ke pulau itu untuk melindungi pekerjaan yang telah selesai, dan menjelajahi fasilitas baru itu, tepat pada saat organisasi hitam menculik seorang teknisi wanita, yang mencari sepotong data penting di drive USB-nya. Raungan sekrup yang mengerikan terdengar dari laut saat orang tak dikenal mendekati Haibara.