Ditugaskan dalam misi untuk menangkap Mukade, seorang ninja pelarian, Naruto Uzumaki berangkat menuju reruntuhan bersejarah “Ouran” yang dulunya megah, di mana ia mengejar dan menyudutkan para ninja pemberontak. Tujuan Mukade terungkap sebagai leyline yang tidak aktif di dalam reruntuhan; ia melepaskan kekuatan leyline, menyebabkan cahaya menyelimuti Naruto, mengirimnya ke masa lalu, 20 tahun sebelum seri dimulai. Ketika Naruto terbangun, ia bertemu dengan Hokage keempat, Minato Namikaze.