Setelah menyelamatkan nyawa pewaris tahtanya, penyendiri yang ulet, Snake Eyes, diterima di sebuah klan Jepang kuno bernama Arashikage, tempat ia diajari cara menjadi prajurit ninja. Namun, saat rahasia masa lalunya terungkap, kehormatan dan kesetiaan Snake Eyes akan diuji – meskipun itu berarti kehilangan kepercayaan dari orang-orang terdekatnya.